Børnehuset Babuska ledes af en leder og en bestyrelse på fem personer, der har ansvaret for alle økonomiske, administrative og praktiske forhold vedrørende børnehuset. Det fastansatte personale har den pædagogiske ledelse.
Bestyrelsen består af tre forældrerepræsentanter, der vælges på årsmødet i marts/april måned for to år ad gangen samt 2 udpegede medlemmer, der sidder 4 år ad gangen. Desuden deltager lederen samt en medarbejder i bestyrelsesarbejdet.
Bestyrelsen består af:
Grethe Harrebye, formand
Ulrik Nejsum Madsen, kasserer
Birthe Fredslund (forældrevalgt)
Helle Kloster (forældrevalgt)
Louise Mejnertz (forældrevalgt)
Tina Lauritsen (leder)
Malene Bager (medarbejderrepræsentant)